n NATURSTOFKEMI Figur 4. Bakterien CNR107 af stammen Salinospora arenicola, der producerer BE-43547A1, blev dyrket på en agarplade. En enkelt koloni blev opformeret i flydende medie. Efter ekstraktion, fraktionering og HPLC-oprensning blev det rene naturstof isoleret og analyseret. biosyntesen af et medlem fra rakicidin-familien, rakicidin D nelsen af APD-enheden, var arrangeret i en ukonventionel ræk- (ikke vist) [8]. Her opdagede vi, at to protein-domæner i den kefølge. Vi kunne bruge dette som et DNA-fingeraftryk, og ved del af det biosyntetiske samlebånd, som er ansvarligt for dan- hjælp af BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) var vi i stand til at finde bakterier med samme maskineri til at producere stoffer med en APD-enhed. Videre analyse af de fundne match viste, at to kendte bakte- riestammer burde være i stand til at producere BE-43547A . 1 Opdyrkning af bakte- rierne på lille skala og analyse via HPLC-MS (High Performance Liquid Chromatography – Mass Spectrometry) og sam- menligning med de syntetiske isomerer viste, at bakterierne produce- rede BE-43547A-, B- og C-molekylerne. Bakterien Salinispora arenicola CNR107 blev derefter op- dyrket på stor skala (14 L), hvorefter de blev ekstra- Figur 5. Sammenligning af H-NMR spektrum for det isolerede naturstof (rød) med de fire syntetiserede isomerer viser, at 1-A1-anti P2 (blå) matcher. heret med ethylacetat, og BE-43547-molekylerne 12 dansk kemi, 98, nr. 3, 2017
Download PDF fil
Se arkivet med udgivelser af Dansk Kemi her
TechMedias mange andre fagblade kan læses her